يقع حرم جامعة خليفة الرئيس في جزيرة أبو ظبي عند تقاطع شارع السعادة وطريق المطار القديم، حيث توجد الإدارة المركزية للجامعة ويتم تدريس جميع المواد التعليمية العامة.
يغطي الحرم الجامعي الرئيس أكثر من 135000 متر مربع ويضم 105 مختبرات ، بما في ذلك أحدث مختبرات الفضاء والروبوتات تحت الماء ، و 72 فصلاً دراسياً ، وأكبر مركز رياضي أكاديمي في دولة الإمارات العربية المتحدة ، ومنافذ بيع بالتجزئة وطعام ، وموقف سيارات متعدد الطوابق.
تم الانتهاء من توسعة الحرم الجامعي في عام 2016 بمبنى جديد فاز بجائزة أفضل مشروع ثقافي ومؤسسي في حفل توزيع جوائز التصميم الداخلي والهندسة المعمارية للشرق الأوسط وشمال إفريقيا لعام 2015. المبنى مستوحى من التاريخ الفني الغني للمنطقة العربية وتراثها. يحتوي التصميم الداخلي على منحنيات وأشكال بيضاوية تهدف إلى محاكاة جمال ونقاء الصحراء.
يتكون المركز الرياضي الأكاديمي ، الذي يضم أكثر من أربعة طوابق ، من مرافق منفصلة للرجال والنساء تضم أحدث معدات القلب والأوعية الدموية ورفع الأثقال واستوديوهات اللياقة البدنية وملاعب كرة السلة والاسكواش والكرة الطائرة وكرة الريشة.
يتميز الحرم الجامعي الرئيس أيضًا بممر للمشاة يبلغ طوله 200 متر ، يُطلق عليه اسم العمود الفقري الإبداعي ، والذي يمتد في قلب الحرم الجامعي ، ويوفر مناظر واضحة للمباني الرئيسة ، مع تشجيع الابتكار من خلال التفاعل وبيئة أكاديمية تعاونية.
يحتوي الحرم الجامعي الرئيس على مكتبة وعيادة وأماكن لجلوس الطلبة وغرفة طعام والعديد من المقاهي والمطاعم.